アルテミスが学園の上空に到達するまで、舞衣たちに残されたのはわずか6時間。それまでに、アリッサの行動を封じなくてはならない。そして、舞衣たちは、風華学園奪還作戦という名のもと、さっそく行動を開始するのだった。

舞衣と碧は湾に展開するシアーズの艦隊をチャイルドで攻撃。砲撃にさらされつつもなんとか撃退していく。なつきと命、奈緒もそれぞれ別の場所から学園を包囲している地上の兵たちをなぎ倒す。各所からの攻撃で、シアーズの部隊は混乱に陥り、やがて大半の兵力が舞衣たちによって失われてしまう。

そして、雪之のチャイルド「ダイアナ」が映し出す画像から、アリッサと深優の居場所を教えられた舞衣たちは、彼女たちがいる海岸へ向かった。そこに到着した舞衣は、アリッサたちに学園から去るように説得するが、アルテミスの射程がすでに学園をとらえていると言われ、逆に降伏を迫られる。

しかし、アリッサは舞衣に返答する間も与えず、地上へ向けてビームを放ってしまう。そんなアリッサの行動に、舞衣はビームを防ぐため、カグツチとともにその方向へ向かっていく。だが、ビームは無情にもカグツチに直撃し、大爆発を起すのだった。

その爆発によって、カグツチの破壊に成功したことを確信するアリッサ。しかし、再び姿を現した新たな姿のカグツチと舞衣の姿に、驚愕の表情に変化する。そして、カグツチはそのまま舞衣を乗せ、アルテミスのいる場所を目指し急上昇していく。とつぜんのカグツチの行動に混乱する舞衣をよそに、やがて宇宙空間に到達したカグツチは、アルテミスの破壊に成功するのだった。
アルテミスの破壊によって倒れるアリッサ。爆発を確認したなつきは、戦うすべの無くなった彼女たちに降伏を迫る。だが、今度はその場所に向けてミサイルが襲い掛かる。それは計画に失敗したアリッサたちを消去するために、シアーズ財団が放ったミサイルだった。

逃げるなつきたち。そして、その気に乗じた深優も、アリッサを連れて、なんとか裏山まで逃れることに成功した。しかし、そんな彼女たちの前にジョセフが現れる。深優が目を離した隙に、アリッサを死へと至らしめる注射を打つ。計画に失敗したときに、アリッサの始末を命じられていたジョセフだったが、そんな彼自身も深優の武器によって貫かれてしまうのだった。

だが、すでにときは遅く、やがて目を閉じていくアリッサ。そのアリッサの死は、舞衣たちHiMEを狙うシアーズ財団の計画が終わりを告げたことを意味していた。