闘う意味を見失いあて度も無く街を行くルルーシュ。このままゼロを棄ててしまうのか？
迷い彷徨い無人のアッシュフォード学園でルルーシュが観たものは？
同じ頃、トウキョウ湾に侵入した黒の騎士団にスザクが迫る！
ゼロも騎士団もこのまま壊滅してしまうのか！？