戦部ワタルは、正義感が強く元気な小学四年生。ある日、授業で粘土製のロボット・龍神丸を造ったワタルは、何かに導かれるように、登校途中で拾った勾玉をその首にかける。下校途中に龍神池へ寄ったワタルは、突然目の前に現れた金色の龍によって、異世界・創界山へ連れて行かれた。かつて創界山は、七色の虹が輝く美しい世界だった。
　しかし、悪の帝王ドアクダーの出現によって虹は色を失ってしまい、民衆はドアクダーの配下によって苦しめられていた。創界山の英雄伝説――異世界から「ワタル」という名の勇者が現れ、世界の危機を救うという伝説により、ワタルは救世主として創界山を救う使命を負うことになり、粘土から巨大な魔神となった龍神丸と共に旅立つ。旅の途中で、天真爛漫な忍者一族の御頭・忍部ヒミコ、凄腕の剣豪・剣部シバラクと、元々はドアクダーのスパイだったが改心した渡部クラマを仲間に加えてドアクダー討伐の旅は続いていく。
「魔神英雄伝ワタル２」放送開始直前に発売された「魔神英雄伝ワタル」の編集版。